- Отдел биологических исследований
- Отдел компьютерно-технических исследований
- Отдел инженерно-технических исследований
- Отдел судебно-экономических исследований
- Отдел фоноскопических и лингвистических исследований
- Отдел судебно-медицинских исследований
- Отдел геномной регистрации
- Отдел экологических исследований
Структура Аппарата СЭЦ СК России
Административный аппарат:
Директор центра Кречет Александр Евгеньевич
Первый заместитель директора Соболев Александр Михайлович
Заместитель директора Игнашкин Михаил Анатольевич
Заместитель директора Пулин Александр Борисович
Заместитель директора Степанов Максим Валерьевич
Инспектор отдела документационного обеспечения Силкина Елена Сергеевна (приемная директора)
Экспертные подразделения:
- отдел психологических исследований
- отдел биологических исследований
- отдел компьютерно-технических исследований
- отдел инженерно-технических исследований
- отдел судебно-экономических исследований
- отдел фоноскопических и лингвистических исследований
- отдел судебно-медицинских исследований
- отдел геномной регистрации
- отдел экологических исследований
Административно-хозяйственные подразделения:
- отдел организационно-аналитической и методической работы
- отдел кадров
- отдел документационного обеспечения
- финансово-экономический отдел
- отдел материально-технического обеспечения
В основные задачи подразделений СЭЦ СК России входит организационное, научно-исследовательское и методическое обеспечение производства судебных экспертиз и исследований с учётом современных достижений науки и техники; координация экспертной, научно-исследовательской и методической деятельности в филиалах СЭЦ СК России, участие в организации деятельности, связанной с определением (пересмотром) уровня квалификации сотрудников СЭЦ СК России и аттестацией их на право самостоятельного производства судебных экспертиз.